Ao longo da sua existência, a CSBJ tem vindo a adaptar-se e a reorganizar-se de modo a responder às crescentes necessidades e expectativas da comunidade envolvente e às diretrizes das políticas de Saúde Mental. Esta preocupação tem levado a Instituição a desenvolver e implementar uma série de projetos, alguns deles pioneiros a nível nacional, nas seguintes áreas:

• Reabilitação e Integração Profissional;
• Integração Socioprofissional;
• Reabilitação Ocupacional;
• Reabilitação Habitacional;
• Atividades Expressivas e Culturais;
• Formação para Profissionais de Saúde e Cuidadores.